นักบินอวกาศ Glenn และ Fuji สำรวจดาวเคราะห์ X และเผชิญหน้ากับเอเลี่ยนลึกลับที่รู้จักกันในชื่อ Xiliens ซึ่งขอให้ผู้คนบนโลกช่วยกอบกู้โลกของพวกเขาจาก "Monster Zero" เพื่อแลกกับการยืม Godzilla และ Rodan พวก Xiliens จึงเสนอวิธีรักษาโรคมะเร็ง ขณะที่เกล็นน์สืบสวน เขาได้เริ่มมีความรักกับมิสนามิคาวะ และได้ค้นพบความตั้งใจที่แท้จริงของซีเหลียน