Premier représentant du gouvernement sur les lieux de l'incident de Roswell, en juillet 1947, le major Jesse Marcel a toujours été convaincu qu'un vaisseau extraterrestre s'était écrasé ce jour-là dans le désert du Nouveau-Mexique. À sa mort, le major a laissé un journal crypté qui pourrait receler des indices concernant ce qui s'est réellement produit à Roswell. A partir de ce journal, l'ancien agent de la CIA Ben Smith se lance dans une enquête sur le terrain...